O silício branco pode funcionar para tapar os orifícios, mas se você o usar, certifique-se de que a superfície termine da maneira que deseja antes que o material seque. Não é um material que lixe muito bem após o fato.
Você também pode querer experimentar um produto de selador de banheira e pia. Esses produtos preenchem as lacunas bastante bem e secam, mantendo uma agradável cor branca. O produto que usei para pias e banheiras é o mostrado abaixo.
Também esteja ciente de várias coisas. Se parafusos foram aplicados na moldura da janela de PVC, as roscas dos parafusos provavelmente fizeram uma parte da superfície de PVC ficar presa na borda do furo. Pode ser necessário aparar com cuidado para que seus orifícios remendados fiquem planos. Se a moldura da janela for feita apenas de PVC sem estrutura interna de madeira, a única coisa em que o material adesivo estará aderindo são as bordas do furo. Isso significa que o patch poderia aparecer ou sair de alguém que estivesse cutucando.