(Nota: Se alguém quiser adicionar informações específicas sobre a minha resposta, ou copiar e colar minha resposta para usar como base para uma resposta melhor, faça isso. Não sei o suficiente para ser útil !)
Eu presumo que sua abordagem é esta: você quer tentar combinar os livros de regras básicos do 3.0 com o SRD 3.5, presumivelmente porque você quer usar os livros 3.0 para material fonte e conselhos, mas o SRD para blocos de estatísticas e um sistema autoritário de regras. Você quer saber o que você vai perder, ou seja, o que poderia te enganar porque você perdeu a diferença entre 3,0 e 3,5. Vou explicar do ponto de vista do GM, ou seja, você estará planejando uma campanha e já se familiarizou com o 3.5.
Em suma, desde que você lembre de sempre tratar o SRD como a única fonte de crise, você não perderá muito. Uma quantidade muito pequena de dados mecânicos está faltando no 3.5 SRD (como os blocos de estatísticas para os poucos monstros que os Wizards mantinham fora do SRD e a tabela XP do PHB). Você pode usar as versões antigas com segurança, quando necessário, desde que esteja atento às diferenças sistêmicas (como a alteração na Redução de danos). Vai ser fácil saber quando ter cuidado, porque você estará olhando para um livro em vez de um site.
Deixe-me analisar cada norma básica para detalhes.
Manual do Jogador. Honestamente, diga aos jogadores que não confiam no 3.0 PHB e você ficará bem. Tudo o que não é crunch é conhecimento cultural comum neste momento, como saber que anões de fantasia são bons mineiros e gostam de usar machados. A tabela do XP é tudo o que falta, acredito, e não mudou.
Dungeon Master's Guide. Eu realmente possuo o 3.0 DMG, mas não o 3.5 DMG, apesar de não ter o GMed 3.0 em anos. Na verdade, eu faço referência a ele o tempo todo para o meu jogo Pathfinder, por suas ferramentas gerais e conselhos sobre como GM. Então eu acho que você vai se dar muito bem sem o DMG 3.5 e seus jogadores nunca perceberão a diferença, desde que você sempre use o SRD para materiais similares de mecânica de jogo, como o capítulo de itens mágicos. Mas, digamos, a tabela de 100 ideias de enredo nunca estará desatualizada, sabe?
Manual do Monstro. Efetivamente, você estará ignorando o atacado, exceto, por exemplo, lendo as descrições coloridas dos monstros em voz alta para os jogadores, e isso é seguro, já que eles não redesenharam nenhum monstro em termos de conceito (que eu conheço). Existe a questão dos monstros não-SRD, mas, novamente, você saberá ter cuidado ao usá-los, então você ficará bem.