Como Dan forneceu uma resposta muito boa em seu comentário, mas recusou-se a adicioná-lo como uma resposta apropriada, vou postá-lo por uma questão de completude:
O FAQ do IMDB para o filme dá uma boa explicação para o seu motivação (e a razão pela qual isso não foi mostrado):
Why did Agent Gibbs turn rogue?
In the script, Agent Gibbs was a CIA spook who was angry at his country. He knew the terrorists from his CIA days, so they included him in their operation. This scene was considered too long to tell, so it was cut from the film.