Todas as coisas vivas são o resultado de incontáveis mutações graduais ao longo de bilhões de anos, os seres humanos não são exceção. Mas mutantes não são chamados mutantes devido ao fato de que eles foram mutados em algum ponto ou outro, eles são chamados de mutantes porque uma mutação específica deu origem ao X-Gene, que é a fonte de seus poderes. Esta mutação surgiu muitas vezes ao longo de milhares de anos e não é arbitrária.
A razão pela qual as mutações e a evolução são consideradas um grande problema em relação aos X-Men e Mutants em geral é porque elas são consideradas uma subespécie da humanidade, o Homo Sapiens Superior. Dependendo do enredo ou escritor, isso poderia ser retratado como mutantes sendo o próximo passo óbvio na evolução humana, ou que é uma espécie competidora que irá suplantar os humanos, ou algo similar que os coloca em desacordo com o resto da humanidade.