Não, a menos que sua arma natural cause dano não-letal.
With a sap (blackjack) or an unarmed strike, a rogue can make a sneak attack that deals nonlethal damage instead of lethal damage. She cannot use a weapon that deals lethal damage to deal nonlethal damage in a sneak attack, not even with the usual -4 penalty.
(ênfase minha)
Arma natural não é um ataque desarmado e causa dano letal (se não é uma arma natural especial que normalmente causa dano não-letal).