Embora seja freqüentemente omitido nos diagramas, a maioria dos tubos de pitot tem um ou mais orifícios de dreno conectados à câmara de pressão, e são essencialmente "autodrenantes" (a água não entra nas linhas): href="https://i.stack.imgur.com/2hC7t.jpg"> 
Além dos drenos no próprio tubo de pitot, algumas aeronaves têm "câmaras de gotejamento" separadas e drenos para o sistema pitot (e ocasionalmente estático) para remover a condensação ou a chuva que passou pelos drenos (marcada como 2 na foto abaixo): 
Em relação a outros contaminantes, em altitude, o ar é geralmente bastante limpo.
O maior problema que você terá com os contaminantes no tubo pitot é geralmente os insetos (seja construindo um ninho na abertura ou batendo nele em vôo). Coberturas de Pitot podem ser usadas no solo para evitar isso (e elas também são usadas ao lavar ou pintar aeronaves para evitar que água ou tinta entrem no sistema). Muitas vezes, algumas fitas servem ao mesmo propósito - mas você precisa remover a fita ou a capa antes de voar.
