Sua leitura está correta, os PCs têm que fazer uma salvaguarda contra a música de cada harpia individualmente. Você já citou a linha relevante:
A target that successfully saves is immune to this harpy's song for the next 24 hours.
Diz " esta canção da harpia" especificamente, não apenas "harpy's song" ou mesmo "this ability". E dada a nota sobre outras canções harpias no início do parágrafo, os escritores claramente tinham várias situações harpias em mente.
No que diz respeito a ser poderoso, não é realmente um problema. O save é bastante fácil, ao qual os personagens recebem múltiplas chances de sucesso. Além disso, ele exige que situações específicas sejam perigosas e oferece uma economia extra, se for.