Se o seu objetivo é chegar a San Pedro, faz sentido fazer uma excursão Uyuni a San Pedro, em vez de fazer uma excursão Uyuni a Uyuni, seguida de uma viagem a San Pedro. Ambos estão disponíveis em várias agências de turismo em Uyuni.
Não há transporte público de Uyuni para San Pedro (além dos passeios de vários dias). Você teria que primeiro pegar um ônibus de Uyuni para Calama (várias empresas de ônibus fazem a viagem algumas vezes por semana, mas nos mesmos dias), e depois de Calama pegar um ônibus para San Pedro.