Na 2ª Temporada de Star Wars Rebels, o primeiro encontro com o Capitão Rex fez com que ele comentasse que o Imperador havia retirado os clones. Os Stormtroopers são agora totalmente nascidos de nascimentos. 13 anos teriam se passado antes que o primeiro lote de clones fosse ordenado a executar a Ordem 66, outros 19 anos antes da Batalha de Yavin, 3 anos a partir de então para a Batalha de Endor e depois 30 anos para o Despertar da Força. Considerando o envelhecimento acelerado, o primeiro lote de clones teria 130 anos de idade até então. Os clones de Fett estariam todos mortos.
Quanto à razão pela qual os clones não são mais usados? Eles são caros. E os clones originais não eram executores dispostos da Ordem 66 - eles são leais aos Jedi e à República, mas os chips inibidores superavam suas lealdades naturais. Eles foram então liberados (Kanan mencionou clones mais tarde dizendo que eles tinham chips neles, que eles não tinham escolha. Isso indica que ele encontrou clones que saíram dele e não estão mais dispostos a ir em uma matança Jedi) de controle e são claramente traumático e infeliz sobre o que eles foram enganados em fazer. Não é uma boa ideia manter esse tipo de gente por perto para governar seu novo Império.
Na época do Despertar da Força, a Primeira Ordem tem acesso a menos recursos do que antes. A clonagem de fato tinha sido considerada como uma opção de como criar um novo exército de stormtroopers, mas em última análise, a decisão foi tomada para sequestrar bebês e criá-los em um ambiente de lavagem cerebral. Não usar clones foi uma decisão consciente da Primeira Ordem.