O combustível que entra pela sonda de reabastecimento aéreo vai para os tanques de combustível da aeronave, exatamente como o combustível do solo. O esquema abaixo mostra o sistema de combustível do F-16.
sistema de combustel F-16; imagem de f-16.net
Como pode ser visto, a carga de combustível do sistema de reabastecimento aéreo é igual à do reabastecimento no solo, através das mesmas linhas. Outra coisa é que no caso de tanques externos de combustível estarem conectados, eles podem ser reabastecidos primeiro (eles são despressurizados quando o reabastecimento aéreo começar e a transferência de combustível deles parar) antes dos tanques internos serem enchidos.
O combustível vai para a linha central (fuselagem) ou para os tanques laterais, de onde vai para os tanques do reservatório, que abastece o motor, assim como o combustível "normal".