Pode estar relacionado ao tamanho da dosagem. Em Câmara Secreta , Hermione alega que os efeitos durarão exatamente uma hora:
"I'm sure I've done everything right," said Hermione, nervously rereading the splotched page of Moste Potente Potions. "It looks like the book says it should... once we've drunk it, we'll have exactly an hour before we change back into ourselves."
Chamber of Secrets Chapter 12: "The Polyjuice Potion"
E os efeitos parecem durar uma hora; passam alguns minutos no banheiro, depois uns quinze caçam na sala comunal da Sonserina antes que Malfoy os resgate, e depois uma conversa bastante longa. Embora não nos seja dito exatamente quanto tempo eles passam disfarçados, uma hora parece plausível.
Por outro lado, como DVK aponta , Harry parece estar disfarçado com uma dose única de Polyjuice por uma noite inteira. No entanto, isso é explicitamente chamado de "dose grande" (ênfase minha):
Three o'clock on the following afternoon found Harry, Ron, Fred and George standing outside the great white marquee in the orchard, awaiting the arrival of the wedding guests. Harry had taken a large dose of Polyjuice Potion and was now the double of a redheaded Muggle boy from the local village, Ottery St. Catchpole, from whom Fred had stolen hairs using a Summoning Charm. The plan was to introduce Harry as "Cousin Barny" and trust to the great number of Weasley relatives to camouflage him.
Deathly Hallows Chapter 8: "The Wedding"