Do ponto de vista dos vistos, a maneira mais fácil de pensar na região de Schengen é como se fosse um único país, com vários estados. Isso não é tecnicamente correto, mas está perto o suficiente para a maioria das situações.
No seu caso, você chegará à Itália em um voo "internacional" (de um estado não-Schengen) e partirá da Itália em um voo "doméstico" Schengen (para um estado Schengen) - assim você passará pela imigração na Itália. Com base nisso, o seu primeiro ponto de entrada será, de fato, para a Itália.
Apesar de você passar pela imigração na Itália, no Schengen você passa pela alfândega no seu destino final - assim, não há necessidade de retirar suas malas no primeiro ponto de entrada, como há em alguns países. Assim presumindo que sua companhia aérea é capaz de verificar suas malas durante todo o tempo (o que, em geral, elas serão capazes de fazer, presumindo que seja a única companhia aérea e / ou reservada como um único bilhete), você NÃO precisará coletar suas malas na Itália. .
Um visto schengen geralmente permite que você viaje para qualquer país da região Schengen - mesmo que você não tenha especificado quando solicitou o visto. Dito isto, como acontece com qualquer pedido de visto, nunca é uma boa ideia mentir ou deixar de fora a informação. Se você acha que provavelmente vai visitar a Alemanha e a Áustria, então você deve listá-los como destinos no aplicativo. Se é mais do que apenas um plano de "planos podem mudar e eu posso ir lá um dia", então você pode facilmente deixá-los de lado - se seus planos mudarem e você acabar lá, então você não terá nenhum problema como um resultado.