Respondendo a primeira parte: Por que Kal-El e não outros kryptonianos?
Eu não li o melhor do mundo, mas de acordo com o que você apresentou e uma breve visão geral do assunto, é óbvio que o Intri queria o Kal-el e não os outros kryptonianos. A razão é Kal-el, cresceu na Terra e manifestou seus poderes (os outros criptonianos são apenas kryptonianos; não são seres superpoderosos).
Agora, sua segunda pergunta: Por que Kal-El da Terra-2?
O motivo é apresentado em Batman / Superman Vol 1. Edição 3 .
Tendo passado mais tempo sob o sol amarelo do que o seu homólogo da Terra Primária, o Earth-2 Kal-El descobriu uma maior amplitude de suas habilidades antes de sua morte (btw, ele morre aos 29 oops!). Veja no trecho acima. O próprio Primeman da Terra diz que não desenvolveu tais níveis de controle até os 29 anos (quando o Earth-2 Kal-El fez isso em 22).Então ele (Terra-2 Kal-El) sendo um Super-homem superior (de certa forma) poderia ter feito o Darkseid escolher o Super-homem da Terra-2 sobre o Super-homem da Terra.