Baseado no fato de que ele insistiu que Harry morou com Dudley e Co em Privet Drive (para lhe dar proteção contra o sangue), ele deve ter sabido / suspeitado desde o começo.
Como discutido nas perguntas anteriores, a proteção contra o sangue era contra Voldemort apenas, então não teria sentido colocar Harry em um ambiente tão hostil (e Dumbledore é inteligente o suficiente para saber que é pelo menos um tanto hostil) adotar / adotar com um dos membros da Ordem da Fênix, se não por ele se preocupar com a volta de Voldemort.