A explicação fora do universo é que o design original do personagem foi baseado em homens strongs do circo (assim, a combinação de calças e roupas íntimas no lado de fora), e ele não foi retratado tão strong quanto ele eventualmente se tornou. "Ser capaz de pegar um carro pequeno" não significa que ele poderia facilmente pegar qualquer outra coisa, então se exercitar para ser ainda mais strong faz sentido. É claro que isso não fazia sentido na Era de Prata, quando ele tinha quantidades obscenas de poder e o possuía desde que era bebê, mas naquele momento o projeto dele havia sido definido.
A outra explicação é que a maioria dos artistas tinha uma "build heróica" padrão que eles usavam para praticamente qualquer personagem, então não importava qual era o seu powerset. Não há razão para Hal Jordan também ser construído como um homem strong; pilotos de teste podem estar em forma, mas geralmente não se parecem com fisiculturistas.
No universo, a ideia que existe desde os anos 1980 é que o Superman não tem todo o seu poder desde o início; levou algum tempo para se desenvolver enquanto crescia, e parte desse processo de amadurecimento se tornaria extremamente adequado à medida que ele se desenvolvesse fisicamente, e ele poderia ter pressionado seus limites à medida que seus poderes crescessem, então quando seus poderes alcançaram o ponto em que si mesmo para melhorar tornou-se bobo, seu corpo já havia desenvolvido.
A última possibilidade não é uma que eu possa lembrar de ter visto, mas provavelmente já foi usada: Kal-El vem de um planeta com alta tecnologia, incluindo ciências biológicas. É possível estar tão desenvolvido simplesmente em seus genes e os kryptonianos se prepararam para parecer assim.