Isso é normal, esperado e desejado. A longa fervura dos ossos dissolverá o colágeno no tecido conjuntivo, criando gelatina, o que fará com que ele seja literalmente gelificado quando esfriado.
Isso dá ao estoque um corpo e textura que é considerado uma virtude em usá-lo para sopa ou como ingrediente em outras receitas. Quando aquecida, a gelatina vai derreter novamente.