Um grande problema em não ter um baralho completo é a party / class / roll synergy . Vai ser infinitamente mais difícil para os seus jogadores se, por exemplo, eles rolarem Controladores , então eles devem pensar sobre quais rolagens devem ser cobertas e o que você pode fazer sem. DMG, página 31 tem um pequeno trecho sobre isso;
Small groups can’t cover the four basic character roles. If you have only three player characters, you can do without a controller or a striker at the cost of a little damage output.
Isso não quer dizer que você tem um Defender e Leader , embora seja uma boa ideia, mas eles precisam para considerar o que eles estão desistindo de cada rolo que eles não cobrem.
As Habilidades do personagem também merecem ser mencionadas aqui também. Se todos, mais ou menos, escolherem o mesmo conjunto de habilidades, terão dificuldades com desafios de perícias.
Então, isso é algo para os jogadores pensarem.
Agora, o que você pode fazer como o mestre. Você tem algumas opções aqui.
Uma coisa que você pode fazer é usar a tabela de orçamento do XP na página 57 do DMG para ajustar cada encontro para compensar a falta de PCs. Em vez de adicionar monstros para preencher seu orçamento de XP, você remove alguns. Você não tem que acertar o valor exato dado, contanto que você esteja no estádio, você deve ser bom.
Por exemplo, seu orçamento de XP para 3 PCs de nível 1 seria 300, então para qualquer encontro de nível 1 em sua aventura você precisaria remover monstros até que o valor total de XP dos restantes fosse de aproximadamente 300.
Outra coisa seria deixar os encontros como estão, mas escalonar a quantidade de monstros no campo de batalha, ter alguns empatados com alguma outra tarefa e participar na próxima rodada ou duas. Se você tem um grande campo de batalha, pode simplesmente colocar alguns nas bordas, de modo que eles precisem de uma ou duas rodadas para chegar aos PCs.
No caso de desafios de perícias, não tenho muita certeza. Você pode tentar reduzir o nível de complexidade em 1. Depende da diversidade de habilidades escolhidas pelo seu jogador para saber se ele deve ou não ter uma chance de sucesso se você deixá-lo ou alterá-lo.