Três motivos pelos quais posso pensar:
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É fácil detectar a presença geral de um dispositivo de transmissão específico (por exemplo, uma antena WiFi), mas é muito difícil localizá-lo com precisão . Eles poderiam dizer se há um no avião, mas alguém com um equipamento muito sensível teria que subir e descer pelos corredores apontando para as pessoas para encontrá-lo no bolso de alguém. E os telefones celulares (quando não estão em uso) geralmente são transmissores de estouro: eles não são transmitidos continuamente, eles apenas "fazem ping" da torre de vez em quando. Isso significa que pode levar muito tempo e muito ritmo no corredor.
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Muitos "dispositivos eletrônicos" que são proibidos são totalmente passivos e não têm emissões rastreáveis [*]. Pense em câmeras, receptores GPS portáteis, iPods. (Por outro lado, essa passividade também significa que é extremamente improvável que ela interfira de forma prejudicial na operação do avião, mas, certo ou errado, esses dispositivos ainda são proibidos em alguns casos.)
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Não é tão importante . Existem alguns incidentes em que a interferência eletrônica é suspeita como possível fator, mas não há evidências conclusivas. Tão logo haja um acidente fatal em que um dispositivo eletrônico possa ser conclusivamente culpado como a causa (e duvido que isso aconteça), as companhias aéreas estarão mais dispostas a gastar o tipo de dinheiro que seria necessário para implementar isso.
Para uma discussão completa e baseada em evidências sobre os riscos reais, encaminho para esta pergunta no Skeptics Stack Exchange: Os eletrônicos pessoais são um risco para a aviação comercial?
[*] Não há emissões