Votei a favor de encerrar esta questão, mas retirei o meu voto atento porque apercebi-me de que existe um ângulo distinto no espaço Schengen. O Código das Fronteiras Schengen era recentemente alterado para exigir uma verificação mais rigorosa dos viajantes da UE quando entram no espaço Schengen. O código prevê explicitamente que essa verificação pode ser feita antes que os passageiros cheguem usando as informações fornecidas nos manifestos de passageiros.
Portanto, se você fizer o check-in de um voo para o espaço Schengen usando seu passaporte não pertencente à UE e apresentar seu passaporte da UE na fronteira, as autoridades de fronteira poderão realizar consultas adicionais ao banco de dados do seu passaporte da UE, porque não foram capazes de fazer isso antes. Isso pode atrasar sua entrada em alguns segundos ou minutos e pode ser considerado uma "falha de segurança".
No entanto, este seria apenas um atraso administrativo, porque, como cidadão da UE, o seu direito legal de entrar no espaço Schengen só pode ser reduzido se for uma ameaça à segurança pública ou à saúde pública ou por razões de ordem pública. Fazer o check-in de um voo com passaporte não pertencente à UE não implica nenhuma dessas razões.
O texto atual do Código de Fronteiras Schengen, artigo 8, parágrafo 2e:
2e. The checks against the databases referred to in points (a) and (b) of paragraph 2 may be carried out in advance on the basis of passenger data received in accordance with Council Directive 2004/82/EC [footnote removed] or in accordance with other Union or national law.
Where those checks are carried out in advance on the basis of such passenger data, the data received in advance shall be checked at the border crossing point against the data in the travel document. The identity and the nationality of the person concerned, as well as the authenticity and the validity of the travel document for crossing the border, shall also be verified.