Normalmente, você não coloca objetos de metal em um micro-ondas porque pode produzir faíscas e estragar o objeto, o microondas, e pode ser potencialmente perigoso (embora seja muito bom, verifique link por exemplo).
O plástico não absorve tanto calor quando o metal (fenômeno de indução), então o calor local começou a derreter o plástico. Como acontece com qualquer plástico derretido, não é necessariamente bom, mas uma vez resfriado e lavado, não me lembro de ter jogado tigelas ou pratos derretidos, nem acho que tenha sido especialmente recomendado no passado. Sobre essa polêmica das dioxinas, é mais um fato que você não deve aquecer algo diretamente em um plástico que pode liberar dioxina quando aquecido, o que não é o seu caso, já que acho que sua xícara teve tempo de esfriar desde ontem. / p>