Para armazenamento, o maior problema é se você tem um saco plástico de alta qualidade que evita a incursão de oxigênio. Ter algumas pequenas bolhas dentro não é uma grande coisa, se você usar o método da água ou um vácuo. Mas sacos mais baratos / mais finos permitirão o oxigênio ao longo do tempo, e sua sacola começará a se separar da comida, e você começará a ver cristais de gelo.
Para sous-vide, eu não sou especialista, mas acho que o maior problema é que o ar isola a comida e impede que ela atinja a temperatura de forma rápida e uniforme. Eu acho que as pessoas que fazem em casa cozinhar de baixa temperatura recomendam ter um molho ou gordura no saco junto com sua proteína para reduzir os problemas com bolhas. Eu sei que chefs profissionais usarão a técnica ziploc-in-water em casa, com bons resultados.
Eu não acho que adicionar nada à água afetará a densidade / pressão o suficiente para importar.
E sim, as máquinas profissionais de vacinas não apresentam esse problema.