Oficialmente, não.
As aulas de prestígio geralmente não são "pareadas" com as aulas básicas, elas não "substituem" uma turma base. Eles são apenas uma classe diferente que você toma por multiclasse; a única diferença é que as classes de prestígio têm pré-requisitos antes que você possa começar a usá-las.
Algumas classes de prestígio empilham explicitamente com alguma outra classe escolhida para os propósitos de um recurso de classe específico (e apenas esse recurso, exceto uma exceção). Isso é comum para conjuração de magias. Na maioria dos casos, a turma explicará com exatidão que tipo de turma pode acumular, mas não nomeará uma turma em particular - como um alquimista -, mas sim um tipo de recurso de classe, como spellcasting arcano ou, bem, bombas alquimistas. Claro, chemyst mestre é uma exceção, nomeando alquimista.
Infelizmente, o "dano de bomba" de um vivisseccionista, por assim dizer, é sempre 0. Isso significa que adicionar seus níveis de mestre aos seus níveis de alquimista para determinar o dano de sua bomba ainda resulta em 0 de dano de bomba. Não há uma regra global sobre classes de prestígio que avancem recursos trocados do arquétipo no lugar do recurso usual, nem quaisquer regras específicas sobre cheyssts mestres vivisseccionistas.(Pode-se argumentar que o mestre chemyst nomeia alquimista, e não vivisseccionista ou algo assim, e assim o dano de sua bomba é na verdade igual ao de um alquimista normal com tantos níveis quanto você tem no mestre chemyst, ie você apenas trata seus níveis alquimistas são 0. Mas mesmo se nós estipularmos isso, você não se dá bem, pois você tem algum dano hipotético a bomba sem a habilidade de realmente usar bombas.)
Dito isto, não há razão real para um GM se opor a masterizar o empilhamento de cheiros com vivisseccionista para ataques furtivos. Eu certamente faria se fosse eu. Eu perguntaria.