Não, isso não acontece. O ATC pode especificar uma restrição para o desvio, especialmente em um ambiente sem radar, onde eles não podem ficar de olho em você.
A única coisa que libera o ATC de responsabilidades de separação entre duas aeronaves IFR (ou IFR / VFR dependendo do espaço aéreo) é quando uma delas reporta a outra à vista, e é emitida uma "manutenção de separação visual". Depois disso, a responsabilidade de não acertar a outra aeronave, ou o seu rastro, depende apenas do piloto no comando.