Sim, isso pode (irá) causar problemas. A maioria dos oficiais de imigração combina fotos de passaporte e visto com a pessoa à sua frente. Mesmo que isso não seja seu erro, você pode sofrer por causa disso. Meu conselho é enviar os passaportes de volta e corrigir isso. Se você tem um consulado em sua cidade, entre em contato com eles. (Muitas vezes, o oficial de imigração no aeroporto de Kuala Lumpur provavelmente entenderá sua situação e poderá deixá-lo ir, mas eu não aconselharia que você viajasse com a suposição de que a sorte vai jogar a seu favor.) Tenha uma boa viagem.