Totalmente especulativa, pois não a vemos fazer isso, mas
Rey os roubou.
O espectador acredita que Luke estava prestes a queimar os textos sagrados e que Yoda fez isso por ele, porque Yoda acreditava que é hora de Luke seguir em frente e perceber que seus alunos vão crescer além dele. Yoda quase certamente sabia que Rey havia pegado os livros, já que ele parou Luke e acendeu o templo. Além disso, quando Luke é tentado a entrar e salvá-los, Yoda faz o fogo explodir para fora. É após esse ponto que Lucas percebe o que deve fazer.
Yoda certamente sabe que Rey os tem desde que ele diz:
There's nothing in that library that Rey doesn't already possess
Source: just watched it again.
Acho que é lógico supor que o acima dado é uma das primeiras ocorrências de livros no universo, então é improvável que houvesse várias cópias que ela adquiriu e a visão no final era uma maneira de dizer ao espectador "Rey ainda pode aprender".