Provavelmente você está voando na Air Baltic. Aqui está o que eles dizem no site deles :
Security check and passport control. If you are travelling from:
Schengen to Schengen country - you do not need to go through a security check and passport control.
Schengen to Non-Schengen country - you have to go through passport control.
Non-Schengen to Schengen country - you have to go through a security check and passport control.
Non-Schengen to Non-Schengen country - you have to go through a security check.
A Alemanha é um país Schengen e a Ucrânia não é. Então, no caminho até lá, você terá que passar pelo controle de passaporte, mas não pela segurança; e no caminho de volta, você terá que passar pelo controle de segurança e passaporte.