O problema com a visualização fora de ordem não é tanto spoilers como coerência. Em geral, as coisas farão mais sentido se vistas em ordem de produção (não necessariamente o mesmo que a ordem de transmissão / liberação). Por exemplo, TOS "The Cage" poderia ser o lugar ideal para começar, porque foi o primeiro episódio escrito / produzido, mesmo que nunca tenha sido transmitido como tal (mas foi cortado na segunda parte "The Menagerie"), e apresentado apenas em sua forma original décadas depois. Da mesma forma, muito do que acabou se tornando o cânone de Star Trek, como sabemos, evoluiu (em ordem de produção) nos primeiros 8 ou 10 episódios da primeira temporada de TOS. Observá-los em ordem de transmissão (como todos teriam em 1966) pode parecer um pouco confuso; conjuntos, trajes (uniformes), aparência e comportamento de Spock, terminologia, etc. todos evoluíram e levaram até o décimo episódio para cristalizar.
O TNG teve algum desenvolvimento de personagem menor durante a sua execução (uma grande mudança de elenco se aproximando do final da primeira temporada), e algumas histórias referenciam eventos de episódios anteriores, então faria mais sentido assistir em ordem. Além disso, os primeiros e últimos episódios (ambos de 2 participantes) reservam a série, portanto devem ser assistidos em ordem de série.
O DS9 teve grandes arcos em suas últimas temporadas e também teve seus primeiros e últimos episódios.
A Voyager pode ser assistida fora de ordem, exceto no primeiro episódio que estabelece o programa e no último episódio que, novamente, serve como um suporte para livros. Não há arcos de história, no entanto existem vários arcos de personagem que farão mais sentido quando o show é assistido em ordem de transmissão, especialmente uma grande mudança de transmissão que ocorre nas temporadas de ponte de dois lados e 3 & 4.
A terceira temporada da empresa tem um arco maior e deve ser vista em ordem. Novamente, os primeiros e últimos episódios da série são suportes de livros. Assistir a série inteira em ordem pode oferecer uma recompensa - ver a tecnologia familiar da Trek e outras convenções se acumularem um pouco de cada vez.
Quanto aos filmes: # 3 (Search for Spock) constrói sua história no final de # 2 (Wrath of Khan). Embora o # 4 (Voyage Home) conte uma história independente, seu começo começa com o estado no qual o nº 3 termina. Isso faz filmes 2,3 e 4 uma espécie de trilogia solta.