Por que não?
Como você mencionou, ele se lembrou do experimento de Striker no X2. Ao mesmo tempo, ele também pode ter se lembrado de todas as partes de sua memória perdida ou desencadeado alguma regeneração do processo de células cerebrais perdidas (IMAHO ele é um mutante com capacidade de regeneração).
A Fox já estava começando a corrigir seus problemas de continuidade antes do The Wolverine, então não é um problema autônomo ou de continuidade. A Fox está planejando muito nos próximos anos e agora perder tempo mostrando mais um telepata ajudando o Wolverine a recuperar sua memória certamente levará algum tempo de tela que pode parecer desnecessário para eles.
Para os fãs de quadrinhos, Wolverine é muito complicado em perder e ganhar memória, Quero dizer que aconteceu tantas vezes . Então ninguém (pelo menos eu) vai gostar de ver isso de novo e de novo. Então, é um bom passo para não mencionar a perda de memória novamente.
Uma outra explicação pode ser a passagem do tempo mencionada por @Vedran Šego, de qualquer forma que diz , perdida memórias não podem voltar?