Na Matriz, Neo é pego pelos Agentes quase imediatamente após seu encontro com Trinity e durante sua ligação com Morpheus.
A minha pergunta é: por que os Agentes não pegaram o Sr. Anderson antes de ele se tornar o Neo (o Agente conquistando o pior)
O contato de Morpeus / Trinity com o Sr. Anderson desencadeou sua localização no radar dos Agentes?
Os agentes não se importavam com Neo. Eles não tinham ideia de que ele iria se tornar o grande Herói, provavelmente porque eles nunca foram ao cinema e não sabiam quem era Keanu Reeves.
Os agentes só queriam encontrar Morpheus para que pudessem obter os códigos de acesso ao mainframe de Zion. Eles sabiam que Morpheus estava procurando por Neo, então eles esperavam recrutar o novo garoto para ajudar Cipher a trair os outros humanos livres.
Até aquele momento, a Neo estava sendo rastreada pelos agentes. Então, presumivelmente, era do seu interesse deixá-lo interagir com Morpeus e Trinity.
Spoiler:
The One's purpose is to return to the Source, resetting the Matrix to its prime program. Afterwards, he will choose sixteen females and seven males to repopulate Zion and provide another round of humans for the "rebellion".
Sua pergunta é respondida no filme por Morpheous. Depois que ele acorda em sua casa, Morpheus o chama e diz a ele: "Se eles soubessem o que eu sei, você provavelmente estaria morto".
No terceiro comentário, é mencionado que é estranho porque eles não matam uma ameaça. No começo eu acho que eles não querem matar uma pessoa que pode levá-los ao Morpheus lendário (como Angus disse no primeiro comentário) e em segundo lugar eles não querem matar uma bateria!
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