Depende das regras da companhia aérea e da tarifa reservada. Geralmente, se o bilhete for reembolsável - tudo deve ser reembolsado. O governo não cobra taxas e impostos se você não viajar. A companhia aérea - pode.
Como calcular as taxas exatas - o seu agente de viagens provavelmente pode ajudá-lo com isso, elas têm esse problema. Se reservou online - poderá não conseguir obter esta informação na confirmação (lembro-me de obtê-la de alguns sites de reserva online, mas definitivamente não da maioria deles).
Lembre-se de que a alteração no preço do seu bilhete não reflete necessariamente a alteração no seu itinerário de forma linear.