Não afeta automaticamente negativamente, mas:
Se você está sendo entrevistado para o seu visto, você deve estar preparado para responder a perguntas sobre a loteria do green card paralelo; basicamente, você precisa convincentemente explicar sua 'dupla intenção' ; ou seja, "você está tentando obter o visto não-permanente e depois deixa o país conforme necessário; mas, ao mesmo tempo, aceita receber um cartão verde e imigrar".
Veja # 10 sobre este FAQ do governo: link
Existem muitas discussões sobre efeitos cruzados, mas nenhuma declaração oficial do USCIS. Aqui está um exemplo de uma opinião qualificada: link