Não, eles não são iguais. O período de validade é definido quando você pode usar seu visto e a duração da estadia determina quanto tempo você pode permanecer no espaço Schengen durante este período de validade. Portanto, não é incomum que o período de validade seja mais longo do que a duração da estadia, dando a você um pouco de flexibilidade para adiar ou antecipar sua viagem (mas não para ficar muito mais tempo do que o planejado originalmente).
O oposto, um período de validade menor do que a duração da estadia, não faz sentido (não é explicitamente proibido em qualquer lugar, mas não deve acontecer), pois você deve deixar o espaço Schengen antes do vencimento do seu visto (ou garantir outro título para ficar). Além disso, a duração da estadia para um visto Schengen regular deve ser no máximo 90 dias, mas o período de validade pode ser muito mais longo (até 5 anos).
Então você pode muito bem obter um visto válido apenas para as datas que você colocou no pedido ou para a sorte e obter mais do que solicitou, mas não há motivo para que o período de validade seja de 90 dias. Em princípio, o que você deve obter é um visto com uma duração máxima de 7 dias durante um período de duas semanas ou algo assim (isso é recomendado pela comissão da UE, mesmo que os consulados sejam legalmente livres para emitir outra coisa e prática real varia de lugar para lugar).