Você tem duas linhas de história misturadas.
A maioria destes eventos (itens 1 e 2 da sua lista) ocorreu em Uncanny X-Men 129-138. Eles foram uma virada crítica na Saga Phoenix, na qual Jean foi manipulado por Mastermind (Jason Wyngarde), e eventualmente se tornou a Fênix Negra.
Não havia cicatrizes em Wolverine neste enredo, apenas um monte de cabelo e um uniforme rasgado. Mas encontrei as cicatrizes cruzadas em outro enredo e incluí uma captura de tela e mais informações abaixo.
Do estranho X-Men # 132:
Jean está na fantasia implantada em sua mente por Mastermind, enquanto Cyclops, de volta ao mundo real, olha para a cena como ela está realmente tocando. O traje mais velho na mente de Jean é visto no primeiro painel abaixo, a roupa real usada na festa no próximo.
Do estranho X-Men # 133
Neste ponto, o resto da equipe é capturado, e somente o Wolverine está livre para tentar resgatá-los.
Do estranho X-Men # 162
Item 3, as cicatrizes entrecruzadas que você perguntou estavam em um enredo posterior, mas relacionado , onde encontraram a Prole e o Wolverine foi danificado e infectado. A foto abaixo não deixa claro, mas ele está infectado, como seu comentário acima indica.
As duas linhas da história estão relacionadas em que tanto a Saga da Fênix Negra quanto o encontro com a Ninhada envolvem o Shi'ar.
