Isso é pura especulação da minha parte, mas na minha experiência "Mas eu estive errado antes" é uma frase muito comum. Eu uso muito, por exemplo, para reconhecer que minha opinião é apenas uma opinião.
Neste contexto, sempre tomei a linha de Gordon como significando:
- Ele sabia que estaria em minoria confiando em Batman
- A distância e a desconsideração de Batman por qualquer tipo de estrutura de poder oficial (ele não tem uma afiliação formal com o GCPD, que ele demonstra repetidamente ao desaparecer no meio de conversa de Gordon; seus métodos são altamente ilegais; etc.) duvidar de seu instinto de confiar em Batman
Não é necessariamente uma referência a um evento passado.