Primeiro de tudo, ótima pergunta. Parece que se os Chronicoms realmente deveriam proteger a humanidade das ameaças de extinção, já teríamos ouvido falar deles antes. O fato de que há tão pouca informação sobre eles torna ainda mais difícil responder à sua pergunta. No entanto, aqui está minha opinião sobre isso:
- As Crônicas não interferiram quando os Chitauri invadiram a Terra porque os Chitauri não estavam tentando massacrar a humanidade. Eles estavam tentando escravizá-lo. Se este é o caso (e é possível que eu esteja errado aqui), então isso explicaria por que as Crônicas não agiram.
- A missão da colmeia de dominar o planeta e transformar humanos em desumanos é mais difícil de responder. As únicas razões pelas quais posso chegar são que eles calcularam que ele não seria capaz de cumprir sua missão, eles estavam esperando até que fosse provado ser uma possível ameaça à sobrevivência da humanidade, ou eles consideram desumanos um desdobramento de humanos. Se eles considerassem os humanos desumanos humanos tecnicamente, então isso não se qualificaria como um evento de nível de extinção.
- Dormammu é outro duro, mas pelo que me lembro, ele estava basicamente tentando mover a Terra para a Dimensão das Trevas, onde (de acordo com os quadrinhos) ela não deveria ser destruída, mas preferiria apenas se fundir com outras dimensões. Isso causaria muito dano, mas não acho que exterminaria a humanidade. Talvez seja por isso que os Chronicoms não interferiram.
- Finalmente, parece que Ultron derrubando uma cidade de volta à Terra não exterminaria a humanidade (corrijam-me se eu estiver errado aqui; já faz um tempo desde que vi Avengers 2), então talvez seja por isso que os Chronicoms não interferiu.
Você acha que isso é plausível? Há também a possibilidade de que Chronicoms não tenham sido apresentados ao MCU na época desses eventos, então os escritores não os incluíram por esse motivo, mesmo que realisticamente devêssemos tê-los visto. Mas honestamente essa é uma resposta bastante insatisfatória.