Ele parece um pouco zangado ou amargo quando diz essa frase. Você poderia dizer isso a ele suspeitando que ela está pensando nessa pergunta, o que de fato tornaria isso um pouco sarcástico.
No entanto, dadas as suas circunstâncias: um homem procurado por homicídio, um homem que opera diariamente com criminosos que provavelmente não guardam os seus pensamentos para si próprios - é provável que esta não seja a primeira vez que ele teve esta conversa, e que outras pessoas têm sido menos generosas em sua presunção de sua inocência, ou até mesmo menos propensas a ficar caladas quando contadas.
Minha impressão dessa troca foi que ele teve essa conversa antes, e ficou amargamente satisfeito por ela não ter feito a pergunta imediatamente. Amargamente porque ele provavelmente sabe que está em sua mente, mas que ela não deixou escapar. Ele diz o "obrigado" muito em breve, por isso também consegue evitar a chance que ela está prestes a pedir. Ele consegue ambos implicam que ele acredita que ele é inocente, sem o constrangimento de ter que lidar com a questão diretamente.