Desde que seja internamente consistente, não há erro.
Quando você constrói um monstro, você escolhe o bônus de proficiência, ataques, defesa, etc. Então, com base neles, o CR é definido. De acordo com o guia do DM, o CR não tem nada a ver com o bônus de proficiência, mas sim com a média dos CRs equivalentes ofensivos e defensivos.
O guia do DM tem alguns palpites sobre o que você deve começar, mas está claro que isso é ajustável dependendo da sua criação.
Por exemplo, você pode criar uma preguiça gigante, com baixa proficiência, ataques baixos e HP alto. Isso geralmente daria um CR mais alto, devido ao alto HP, que não necessariamente se alinhará com o bônus de proficiência sugerido no guia do DM baseado em RC.