Eles já estavam escondidos. No início da segunda temporada, o presidente assinou o "Alien Anistia Act", permitindo que os alienígenas que estavam escondidos na Terra saíssem das sombras e vivessem vidas comuns e pacíficas.
Supergirl: Wait, the President is coming here?
Alex: Yeah, she wants to tour the DEO while she's in National City to sign the Alien Amnesty Act.
Supergirl: It's amazing, an executive order allowing aliens on Earth to come out of the shadows and live as full citizens.
Quanto a como eles chegaram lá, a resposta curta é que a viagem mais rápida que a luz está prontamente disponível no universo do Super-Homem. A mera existência do DEO antes do acidente com Fort Rozz mostra que as chegadas alienígenas estão acontecendo há décadas antes do início do show.