Tanto as facas Santoku quanto as francesas trabalharão para os mesmos tipos de coisas, então muito disso se resume a preferência. Facas Santoku são mais leves, então isso pode levar a menos tensão da mão e corte mais rápido. Uma coisa que os Santoku são muito bons é cortar fatias muito finas de vegetais, por duas razões: primeiro, como você aponta, você não usa um movimento de balanço, mas sim corta em um movimento, que com a prática pode ser mais rápido e mais eficiente. Em segundo lugar, as facas Santoku geralmente têm um ângulo de lâmina muito mais fino (cerca de 15 graus contra 30-40 graus em uma faca francesa). Isso ocorre porque um lado de um Santoku é plano, e o outro lado é chanfrado (como um cinzel), então você só afia um lado. Para acomodar essa lâmina fina, as facas Santoku serão feitas com um aço mais duro, o que ajuda a manter a nitidez da lâmina, mas pode aumentar a propensão para lascar se usado de forma inadequada, além de torná-las mais difíceis de afiar.
Ainda assim, a preferência pessoal determina qual faca usar. Muitas pessoas preferem o estilo Gyuto de faca, que (grosso modo) combina características de facas Santoku e facas francesas. Eles são feitos de um aço endurecido, são afiados em ambos os lados, mas mantêm as bordas em torno de 22-26 graus. Os Gyutos, como os Santokus, são bastante leves. Gyutos também tem uma barriga arredondada, mas é menos pronunciada do que em uma faca francesa.
Há muito mais a ser dito, mas basicamente a coisa a fazer é colocar as mãos em algumas facas e começar a experimentar - veja o que você gosta!