Sim, um saco de exploração poderia destruir a esfera
Se olharmos para a página 225 do 5e SRD , sob o item mágico Handy Haversack , vemos o seguinte:
Placing the haversack inside an extradimensional space created by a bag of holding, portable hole, or similar item instantly destroys both items...
(ênfase minha)
A partir disso, podemos determinar que o interior do Bag of Holding contém, de fato, "um espaço extradimensional, como aquele dentro de um buraco portátil". A lógica é que, se o espaço na sacola estiver próximo o suficiente de um Furo Portátil para destruir a mochila, ele é similar o suficiente para a Esfera de Aniquilação . Então, se a esfera é colocada no Saco de Retenção , um resultado aleatório é determinado pelo Mestre, o que pode incluir a destruição da esfera.