Se você desconectou ou desligou a água, não deve haver efeitos nocivos do ponto de vista da qualidade do ar.
Uma consideração é a eficiência ligeiramente reduzida da obstrução do fluxo de ar. Não me lembro de como essas coisas interferem no duto, mas se elas se projetam elas podem introduzir uma resistência muito pequena ao fluxo, sem nenhum benefício.