Os replicadores são geralmente tratados como "baixa resolução" e incapazes de replicar certos objetos altamente complexos, como órgãos (TNG "The Enemy", VOY "Phage"). Havia replicadores especializados que poderiam realizar algumas dessas tarefas mais difíceis, como o protótipo Genetronic Replicator no TNG "Ethics".
O Emissor Móvel foi originalmente fabricado no século 29 e incluía materiais (Liga Poli-Deutônica) que eram desconhecidos da Voyager. É provável que os replicadores de navios fossem simplesmente incapazes de gerar esse material futurista, ou que o próprio emissor fosse tão complexo que a "resolução" do replicador não bastaria para duplicá-lo.