Versão Simples : A verdadeira ameaça fantasma foi a que Palpatine / Sidious criou meramente para conquistar o Senado.
O ponto, e usando o nome A Ameaça Fantasma apenas enfatiza, é que a ameaça a Naboo pode ser real, mas é secundária ao objetivo real de Palpatine, que é fazer Naboo se sentir ameaçado ( ou ameaçado), então foi fácil para Palpatine manipular o Senado para fazer o que ele queria.
Mais versão detalhada : Desde que Palpatine controlou os Separatistas (estou incluindo a Federação de Comércio com eles) através de Dooku (sem que ninguém soubesse), ele conseguiu ordenar um bloqueio em torno de Naboo. Como era o seu próprio mundo, isso também ajudaria nas aparências quando ele mostrasse alguma preocupação extra em ajudar a quebrar o bloqueio.
Seu objetivo era que Amidala pleiteia em frente ao Senado e que houvesse simpatia suficiente por sua causa (e ele sendo do mesmo planeta também lhe dava pontos de simpatia) quando ela pediu ajuda e chanceler. Velorum foi capaz de apenas dar a sua retórica padrão, Senators seria atrás dela quando ela se mudou para um voto de desconfiança.
Seu objetivo era colocar Amidala em uma posição tão vulnerável que as pessoas a apoiassem quando pedisse um voto de desconfiança. Então, uma vez que isso acontecesse, seria fácil para ele manipular a simpatia e preocupação nos votos para se eleger como Chanceler.
Enquanto ele estava interessado em Naboo, isso não era tão importante quanto se tornar o chanceler, o que o colocaria em posição de eventualmente assumir o controle do Senado. Apesar de Palpatine ter outros planos para Naboo, o que mais importava era o assunto no Senado.