Esta resposta é toda suposição, não usando nenhuma entrada direta de canon ou WoG que eu saiba:

O mais provável é que não haja trens trouxas que usem aquela linha férrea específica, pois a plataforma da linha está escondida. Mas mesmo que um trem trouxa o use e vá até o fim, ele acabará em Hogsmeade.

Mas, você diz, Hogsmeade é uma cidade mágica. Claro que é. Mas seria fácil montar algum tipo de vigilância nos rastos para avisar a aldeia de uma brigada trouxa que estava chegando. Os aldeões poderiam então se preparar para a visita improvisada e parecerem comuns, se não fossem normais.

Não - os trouxas não podem embarcar em nenhuma das estações.

“Harry had caught the Hogwarts Express the previous year. The tricky bit was getting onto platform nine and three-quarters, which wasn’t visible to the Muggle eye. What you had to do was walk through the solid barrier dividing platforms nine and ten. It didn’t hurt, but it had to be done carefully so that none of the Muggles noticed you vanishing.”
_{^{- Harry Potter and the Chamber of Secrets, Chapter 5 (The Whomping Willow)}}

A outra plataforma, onde os alunos saem do Expresso de Hogwarts para ir a Hogwarts, fica em Hogsmeade.

“They didn’t talk much during the remainder of the journey. At long last, the train stopped at Hogsmeade station, and there was a great scramble to get out; owls hooted, cats miaowed, and Neville’s pet toad croaked loudly from under his hat. It was freezing on the tiny platform; rain was driving down in icy sheets.”
_{^{- Harry Potter and the Prisoner of Azkaban, Chapter 5 (The Dementor)}}

“Harry pulled out the Hogsmeade permission form and looked at it, no longer grinning. It would be wonderful to visit Hogsmeade at weekends; he knew it was an entirely wizarding village, and he had never set foot there.”
_{^{- Harry Potter and the Prisoner of Azkaban, Chapter 1 (Owl Post)}}

O trem de Hogwarts está em seu próprio caminho, a plataforma não é visível para os trouxas, da mesma forma que os trilhos não são visíveis ou estão disponíveis para os trens trouxas.

Mesmo quando você voa sobre Hogwarts em um avião que não é possível ver em Hogwarts, isso pode ser facilmente validado pelo link onde as imagens de satélite não mostram hogwarts ou o Beco Diagonal, que está localizado no centro de Londres e seria facilmente identificado se visível.

Não, eu não penso assim. Depois de assistir a todos os filmes e ler todos os livros, um trem trouxa ao lado do expresso de Hogwarts nunca é visto / mencionado.

Além disso, a pista destina-se apenas a um trem. E se um trem trouxa seguisse o expresso (mesmo sem saber) ele acabaria na estação de Hogsmeade. E então o ministério enviaria os obliviadores para lavar o cérebro do trouxa.

Em algum lugar (eu acho que foi no Cálice de Fogo) Hermione menciona que Hogwarts parece ser uma ruína com sinais de "Perigo" postados por toda parte. Presumivelmente, a estação de Hogsmeade é similarmente encantada para parecer uma estação abandonada. Apenas uma única trilha passa por ela, então é mais provável que ela esteja em um ramal privado com um loop de balão para permitir que o trem virar. Isso explicaria porque a linha não parece terminar na estação.

O viaduto que vemos a passagem do trem é Viaduto de Glenfinnan , que faz parte da rede ferroviária do Reino Unido. Em vez de ter uma linha mágica especial que vai de Londres a Hogwarts, parece mais provável que o Ministério da Magia providencie para que o Expresso de Hogwarts viaje na rede regular de trens sem ser notado.