Eu vou segundo NBenatar mas com um pouco mais de informação:
Cenoura, cebola e alho não são perigosos quando brotam, mas usam suas reservas de açúcar para fazer o broto. Eles vão para baixo muito rápido e ficam emborrachados e inutilizáveis. Sempre que o alho ou a cebola brotam, eu apenas planto-os e uso os verdes.
Batatas são um pouco diferentes. Mesmo após o surgimento, eles ainda podem ter partes utilizáveis por algum tempo. As porções verdes de uma batata são tóxicas (não o suficiente para ser assustador, mas eu ouvi que elas vão te deixar doente se você comer o suficiente). Vale a pena cortar as partes verdes se a batata ainda não estiver macia.