Sim, eles podem ser, mas você vai querer picar cada um com uma faca afiada uma ou duas vezes para evitar que eles explodam. Uma vez feito isso, coloque-os em uma pequena sacola de armazenamento segura no freezer, retire o máximo possível de ar da bolsa e feche-a. Eles mantêm-se razoavelmente bem por cerca de seis meses sem saborear "queimado", mas tendem a ser um pouco fritos ao descongelar.
Eu sempre achei que o fator mushiness tinha a ver com o tempo de congelamento, mas desde que você perguntou, eu fiz um pouco de pesquisa. Aparentemente, o que faz com que as pimentas se transformem em mingau realmente tem a ver com a rapidez com que inicialmente congelam:
The undesirable mushy end product that comes from freezing fruits and vegetables isn't from the act of freezing itself, but from how you freeze. Your ordinary freezer, or even deep freezer, freezes food slowly. Chilies have water in their membranes, and as they slowly freeze, it forms jagged ice crystals that pierce and puncture the membrane, so that when you defrost it, you're left with a leaky and "tenderized" result. The solution to this problem is easy … faster freezing. If the water doesn't have time to form jagged ice, you won't have a mushy membrane.
Vida Feliz (do qual tirei a citação acima) tem um artigo sobre Como usar o gelo seco com segurança para congelar as pimentas rapidamente. (Eu provavelmente vou continuar do jeito que eu sempre tenho e aceitar a confusão, mas se você quiser congelar muitos chiles para uma variedade de aplicações, o método do gelo seco parece promissor.)