Se suas duas pernas estão em bilhetes separados, então a resposta é sim : você precisará verificar novamente suas malas e precisar ter autorização para entrar no país neste caso.
Se você reservou as duas pernas no mesmo ingresso, então você deve poder ficar na área internacional do aeroporto FRA sem fazer um novo teste. Também não haverá verificação de passaporte neste caso. No entanto, note que a área internacional do Aeroporto de Franfurt fecha durante a noite. Portanto, se o seu voo para BOG for às 6h e você chegar a, digamos, 6h do dia anterior, precisará de um visto para entrar na Alemanha. Além disso, verifique com seu agente de check-in no IST que ele imprimiu "BOG" como designação final na sua etiqueta de bagagem.
Mesmo que suas duas pernas não estejam marcadas no mesmo ingresso, você pode convencer o agente de check-in do IST diretamente ao BOG, já que a Turkish Airlines e a Lufthansa provavelmente têm um acordo de entrelinhamento. Nesse caso, você não precisa de visto para entrar na Alemanha. No entanto , não é aconselhável confiar nesta possibilidade, pois às vezes os agentes do portal se recusam a fazê-lo.