O feitiço só se aplica às verificações de habilidade do Ofício.
De acordo com a descrição da Crafter's Fortune feitiço, o bônus só se aplica ao Ofício.
The target is struck by inspiration and gains a +5 luck bonus on its next Craft skill check.
Normalmente, a criação de itens mágicos requer uma verificação de perícia de Magia, mesmo que você esteja "criando" alguma coisa. Se você não usar uma habilidade de Ofício (como alquimia, armas, armaduras, etc.) para fazer itens mágicos, então o bônus não se aplica.
No entanto ...
Aplica-se se você usar a habilidade Ofício para fazer itens mágicos.
E há maneiras muito limitadas de fazer isso. Uma é com o talento Mestre Artesão . Aqui está uma versão abreviada do texto de proeza:
Choose one Craft or Profession skill in which you possess at least 5 ranks. ... You can create magic items using these feats, substituting your ranks in the chosen skill for your total caster level. You must use the chosen skill for the check to create the item.
Em outras palavras, você pode usar Craft (alquimia) no lugar da verificação de Spellcraft ao criar um item maravilhoso. E você ganharia o bônus de Crafter's Fortune no cheque.