Não haverá nenhum problema, contanto que você tenha dias suficientes no seu visto para toda a duração da sua estadia no espaço Schengen.
Eu tenho um visto Schengen de entrada única emitido pela República Tcheca. Eu estou viajando primeiro para Munique. Eu vou ficar mais dias na República Checa do que em qualquer outro país. A última cidade em que ficarei é Budapeste.
Haverá algum problema?
Não haverá nenhum problema, contanto que você tenha dias suficientes no seu visto para toda a duração da sua estadia no espaço Schengen.