Você está absolutamente certo de que o piso se moverá independentemente das paredes. O movimento quando um adulto entra não é tanto quanto um banho cheio de água, digamos, mas ainda é suficiente que você precise de um selo flexível de algum tipo para evitar o acúmulo de água e o crescimento de fungos.
Eu fiz uma pergunta semelhante que o @ChrisF respondeu muito bem, sugerindo que o calafetar deveria ser flexível o suficiente para lidar . Foi o que eu fiz, e até agora não tive vazamentos (tirei os painéis para verificar de vez em quando)